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雖然西弗吉尼亞大學的研究人員看到了最新的官方ChatGPT插件——名為“代碼解釋器”（ Code Interpreter）的教育應用潛力，但他們也發(fā)現(xiàn)，對于使用計算方法處理針對癌癥和遺傳疾病的定向治療的生物數(shù)據(jù)的科學家來說，這款插件的使用存在限制。 “代碼解釋器是一項很有潛力的工具，特別是在教育領域，因為它使學生更易于接觸STEM領域的編程?！蔽鞲ゼ醽喆髮W醫(yī)學院微生物學、免疫學和細胞生物學系的助理教授，也是生物信息學核心的主任 Gangqing "Michael" Hu說：“然而，它并沒有提供生物信息學領域所需的所有功能。這些是可以通過技術改進來解決的問題。代碼解釋器在未來可能會擴展其應用領域，包括生物信息學、金融和經(jīng)濟學等領域?！? 自2022年12月發(fā)布以來，備受歡迎的人工智能聊天機器人ChatGPT引起了商業(yè)、教育和公眾的關注。然而，它并沒有完全滿足從事生物醫(yī)學研究，包括生物信息學這一交叉領域的需求，這些科學家迫切期待著OpenAI的代碼解釋器插件，希望它能填補這些空白。 Hu和他的團隊對代碼解釋器在各種任務中的表現(xiàn)進行了測試，以評估其特性。他們的研究結果發(fā)表在《Annals of Biomedical Engineering》上，結果顯示，這款插件在某些方面表現(xiàn)出色，但仍然存在一些限制。 例如，沒有科學背景的人可以通過代碼解釋器輕松接觸編程或計算機編程。Hu說，它還具有成本效益，并激發(fā)了學生探索數(shù)據(jù)分析的好奇心，提高了他們的學習興趣。他指出，用戶需要理解如何解讀數(shù)據(jù)，并識別結果是否準確，以及知道如何與聊天機器人互動。 生物信息學家依賴精確的編程、計算機軟件程序和互聯(lián)網(wǎng)訪問來存儲、分析和解釋用于現(xiàn)代醫(yī)學進步的生物數(shù)據(jù)，如DNA和人類基因組。 盡管需要對生物信息學進行特定的改進，Hu說，代碼解釋器有助于用戶確定答案的準確性，以及是否存在一種所謂的"幻覺"，即虛構的答案，這在一些情況下可能會誤導。。 “人們知道ChatGPT可以做許多令人印象深刻的事情，但它并不擅長提供引文或參考來支持其答案。如果被問及支持響應的來源，它可能會開始編造參考文獻?！盚u解釋說?！按a解釋器提供了一個解決方案來最小化幻覺。對于可以通過編程解決的問題，代碼本身就可以作為源或引文。這是一個重要的進步?！? Hu的合作者包括來自西弗吉尼亞大學微生物學、免疫學和細胞生物學系的博士后Lei Wang；來自南達科他州立大學的Xijin Ge；以及來自亞利桑那州立大學的Li Liu。 該團隊發(fā)現(xiàn)代碼解釋器能夠將數(shù)據(jù)轉化為圖表和圖形的能力方面具備良好的效果。 對代碼解釋器的升級建議包括，提供互聯(lián)網(wǎng)訪問以下載基因組數(shù)據(jù)，安裝特定于生物信息學的軟件，擴大存儲能力，并支持更多的編程語言。此外，研究人員發(fā)現(xiàn)需要遵守HIPAA等隱私和安全應用法規(guī)。 在測試數(shù)據(jù)分析時，他們發(fā)現(xiàn)了一些限制。該插件僅支持一種計算機程序，Python （生信分析Python實戰(zhàn)練習 3 | 視頻21），且只支持一些專門用于生物信息學的軟件包。此外，它無法訪問互聯(lián)網(wǎng)上的數(shù)據(jù)，也無法處理大文件。這個繪圖功能是真的強大，生信麻瓜的 ChatGPT 4.0 初體驗

利用代碼解釋器作圖的三個例子

"它只允許處理大約100兆字節(jié)左右的文件，但我們處理的文件達到了千兆字節(jié)級別，"Hu說。"此外，它不支持大型數(shù)據(jù)集所需的并行處理，導致性能較慢。" Hu表示，盡管他預計代碼解釋器將會有更多的升級，但他計劃在明年的課程中使用該插件，以幫助學生了解數(shù)據(jù)可視化。"人工智能是一個快速發(fā)展的領域。我希望到那個時候，OpenAI可以克服一些限制，以便它可以用于廣泛的生物信息學編程。" 最后，Hu表示，他將繼續(xù)監(jiān)測和測試新的人工智能編程和功能，因為在這個領域仍然存在許多等待被發(fā)現(xiàn)的創(chuàng)新用途。

生信寶典：ChatGPT 給出提示和代碼后 （偷個懶，用ChatGPT 幫我寫段生物信息代碼），大數(shù)據(jù)還是需要在本地跑，不然上傳下載的速度和分析占用的資源就太多了。

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